文章摘要
孙明玉,冯博,张昭寰,徐马俊坤,刘伟奇,刘海泉,潘迎捷,赵勇.引起凡纳滨对虾急性肝胰腺坏死病的副溶血弧菌MLST新序列型[J].水产学报,2018,42(3):410~418
引起凡纳滨对虾急性肝胰腺坏死病的副溶血弧菌MLST新序列型
New sequence type isolates of AHPND-causing Vibrio parahaemolyticus from Litopenaeus vannamei by multilocus sequence typing
投稿时间:2017-05-23  修订日期:2017-08-23
DOI:10.11964/jfc.20170510847
中文关键词: 凡纳滨对虾  急性肝胰腺坏死病  副溶血弧菌  多位点序列分型(MLST)
英文关键词: Litopenaeus vannamei  AHPND(acute hepatopancreatic necrosis disease)  Vibrio parahaemolyticus  MLST(multilocus sequence typing)
基金项目:国家自然科学基金(31571917,31671779);上海市科委计划项目(14320502100);上海市科技兴农项目(沪农科攻字2015第4-8号,沪农科攻字2016第1-1号,沪农科推字2017第4-4号);上海市教育委员会科研创新计划(2017-01-07-00-10-E00056);上海市教委曙光计划(15SG48)
作者单位E-mail
孙明玉 上海海洋大学食品学院, 上海 201306  
冯博 上海海洋大学食品学院, 上海 201306  
张昭寰 上海海洋大学食品学院, 上海 201306  
徐马俊坤 上海海洋大学食品学院, 上海 201306  
刘伟奇 上海海洋大学食品学院, 上海 201306  
刘海泉 上海海洋大学食品学院, 上海 201306
上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心, 上海海洋大学, 上海 201306
农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海), 上海海洋大学, 上海 201306
上海海洋大学食品热加工工程技术研究中心, 上海 201306 
 
潘迎捷 上海海洋大学食品学院, 上海 201306
上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心, 上海海洋大学, 上海 201306
农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海), 上海海洋大学, 上海 201306 
 
赵勇 上海海洋大学食品学院, 上海 201306
上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心, 上海海洋大学, 上海 201306
农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海), 上海海洋大学, 上海 201306 
yzhao@shou.edu.cn 
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中文摘要:
      针对12株引起凡纳滨对虾急性肝胰腺坏死病(AHPND)的致病性副溶血弧菌,运用多位点测序技术,分析致病菌株的遗传特征。实验选择副溶血弧菌的7个管家基因dnaEgyrBrecAdtdSpntApyrCtnaA,对12株AHPND致病菌扩增测序。将核酸序列上传至PubMLST数据库进行比对后获得每株菌的序列型。收集其他地区AHPND致病性副溶血弧菌的多位点序列分型(MLST)数据,采用eBURST V3及MEGA 5.0软件进行遗传进化分析。结果显示,2014年中国广东分离的AHPND致病株属于一个新序列型ST1710(42、134、99、79、141、41、51),仅与库中ST415及ST975同源性较高。目前,急性肝胰腺坏死致病株的9种ST型可归为2个克隆组和5个单体。经系统发育树进一步分析可知新序列型ST1710与单体ST975遗传关系相近。本研究首次报道中国AHPND分离株的序列型,丰富了PubMLST数据库,并为其遗传进化研究奠定了理论基础。
英文摘要:
      Twelve strains of pathogenic Vibrio parahaemolyticus isolated from Litopenaeus vannamei with acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND) were chosen, and their genetic characteristics were analyzed by the multilocus sequence typing method. Seven house-keeping genes (dnaE, gyrB, recA, dtdS, pntA, pyrC and tnaA) of V. parahaemolyticus were selected as target genes for PCR amplification and nucleic acid sequencing. The sequences of AHPND-causing V. parahaemolyticus in this study were uploaded to the PubMLST database for multi-alignment to determine the sequence type of each strain. MLST data of AHPND-causing V. parahaemolyticus from other areas were collected and the genetic evolution was analyzed by MEGA 5.0 and eBURST V3 software. AHPND-causing V. parahaemolyticus isolated from Guangdong province in 2014 belonged to the new sequence type ST1710(42, 134, 99, 79, 141, 41, 51). Compared with other sequence types in PubMLST database, it has the high homology with ST415 and ST975. The 9 STs of AHPND-causing V. parahaemolyticus were separated by eBURST into two doublets and five singletons. Phylogenetic tree analysis showed that the new sequence type ST1710 was similar to the singletons ST975. Our study is the first report of molecular epidemiology of AHPND-causing V. parahaemolyticus strains in China using multilocus sequence typing, and enriches the PubMLST database and provides an insight into their evolutionary mechanisms.
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